作为医疗志愿者的兰博士带着女儿兰欣儿、儿子兰冰和我们的主角马诺去往波密岛从事野外研究工作。路上，遭遇了可怕的龙卷风，致使乘坐的直升机坠毁。迫降后，几人在丛林中走散了。只有马诺、兰欣儿和兰冰幸运地汇合在了一起。正当几个孩子担忧兰博士的下落之时，部族少女卓玛意外地与几人相遇了，并且推测出兰博士很可能是被哈玛族人带走了。善良的卓玛决定为几个新朋友带路，找寻兰博士。

马诺一行人为了寻找兰欣儿的爸爸兰博士，想要离开沙巴而经由塔鲁曼到达丛林的心脏砂拉越，他们在危险的塔鲁曼丛林里开启新的冒险旅程。

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该片以热带雨林为故事背景，讲述了马诺一行人为了寻找兰欣儿的爸爸兰博士，前往丛林的心脏砂拉越。刚到塔鲁曼，他们就被那的守护神强行带到了塔鲁曼的入口处，马诺和丁凯本想要借助灵兽的力量来与守护神进行抗衡，却无奈被神奇的力量瞬间移动了……在一路上，他们又遇到了越来越多强大的灵兽，还有驯兽师派来的黑色精灵暗煜与假面三人不断制造各种麻烦。丁凯决定独自离开，而后又回来抢夺马诺手中的灵兽，一心想让阿瑟变为完全体……在大家经历了危险、分离、挣扎、走散、重聚等一系列事件后最终成功走出困境，救出兰欣儿和丁凯的爸爸，使丛林得到了拯救并重获生机。

马诺、丁凯和兰欣儿在丛林里告别大家之后搭乘直升机回家，不料途中突遇爪哇岛时隔一百年的火山爆发，在高温的影响下，早已灭绝的远古动、植物从地下纷纷活了过来，变成各种灵兽开始向人类疯狂复仇。 直升机受到火山灰的影响无法正常航行，慌乱中马诺背乘降落伞不小心从飞机上掉落，随后飞机里的其他人迫降在了爪哇岛丛林里。 马诺落地后，被当地的部落人民强行绑走，部落人认为是陌生的入侵者惹怒了火山神才引起的火山喷发，从而想要对马诺加以惩戒，为了证明清白躲避惩罚，马诺只好去拔部落塔顶的剑，不料此时复活的灵兽地懒却突然现身对马诺横加阻止，于是马诺与地懒展开激烈战斗…… 兰欣儿、丁凯和飞行员叔叔在丛林中分头寻找马诺，也面临着各种复活的变异灵兽的威胁和袭击…… 全新的火山冒险之行，究竟他们能否从容应对丛林里的各种全新挑战，大家下一次的会合又会在什么时候呢？一段紧张的丛林冒险旅程由此开始。

作为医疗志愿者的兰博士带着女儿兰欣儿、儿子兰冰和我们的主角马诺去往波密岛从事野外研究工作。路上，遭遇了可怕的龙卷风，致使乘坐的直升机坠毁。迫降后，几人在丛林中走散了。只有马诺、兰欣儿和兰冰幸运地汇合在了一起。正当几个孩子担忧兰博士的下落之时，部族少女卓玛意外地与几人相遇了，并且推测出兰博士很可能是被哈玛族人带走了。善良的卓玛决定为几个新朋友带路，找寻兰博士。

马诺、丁凯和兰欣儿在丛林里告别大家后搭乘直升机回家，途中突遇火山爆发，飞机迫降在爪哇岛丛林中，大家决定寻找失散的马诺，开启新的火山冒险旅程。